Меч Жёлтого императора. Бледное сияние все серий

В 1967 году инопланетные существа, обозначенные как BETA, уничтожают лунную исследовательскую команду и захватывают их корабль. Впоследствии они начинают вторжение на Землю с целью порабощения человечества. Многие страны оказываются под контролем захватчиков, однако Японии удается организовать оборону и сохранить свою территорию. В этих условиях на фронт отправляется Юи, молодая девушка из рода самураев. Ей предстоит участвовать в боевых действиях против инопланетных сил.

Сюжетная арка Alternative начинается с того, что главный герой Такеру просыпается в своей комнате спустя три года после событий Muv-Luv Unlimited. Он осознает, что был перемещен в прошлое, в период действий Unlimited. Столкнувшись с этой ситуацией, Такеру принимает решение не поддерживать план под названием Альтернатива V. Вместо этого он намерен помочь профессору Кодзуки в реализации проекта Альтернатива IV, конечной целью которого является спасение человечества от угрозы BETA.